Domaine : Sciences du vivant - Thématique(s) : Bio-informatique
Stages courts
Génomique des Populations (analyse de données populationnelles) – OBI6
OBJECTIFS
La formation a pour but de donner les bases nécessaires (concepts et outils informatiques associés) à l’analyse des polymorphismes moléculaires : données de séquences, polymorphismes (SNP et microsatellites) à l’échelle intraspécifique. Les analyses réalisées ont pour objectif d’inférer les processus évolutifs : histoire démographique des populations, flux de gènes, recherches de la trace de sélection dans les génomes.
Le contenu de la formation présente de manière théorique l’effet des forces fondamentales de la micro-évolution (dérive génétique, mutation, sélection et migration) sur les polymorphismes moléculaires. Des travaux pratiques réalisées sur des jeux de données réels analysés à l’aide de logiciels standards viennent appuyer la partie théorique. Ces TP permettent de discuter des résultats obtenus et des scénarios évolutifs inférés.
PUBLIC VISÉ ET PRÉ-REQUIS
Public
Biologistes (au sens large), chercheurs, ingénieurs ou techniciens
Pré-requis
Aucun
PROGRAMME
- Fondamentaux en génétique-génomique des populations.
- Utilisation éclairée de logiciels d’analyse de jeux de données populationnelles (polymorphismes génétiques) qui produisent des statistiques résumées et utilisent des simulateurs pour inférer (par ML, MCMC ou ABC) la structure génétique des populations et leur histoire démographique.
Modalités d’évaluation
Certificat de réalisation
Débouchés
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Pour candidater
Responsable(s)
pédagogique
Informations
Catégorie de l’action de développement des compétences : action de formation (article L6313-1 du Code du Travail)
Code FC : B214
Effectif minimal et maximal : 1 à 4. Intégrés dans un goupe de 16 participants (doctorants, étudiants, stagiaires formation continue).
Possibilité de sessions sur mesure ou INTRA entreprise. Contact : christine.mantecon@sorbonne-universite.fr
| Session |
du 31/03/2025
au 03/04/2025 |
|---|
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