Dernière mise à jour le 13/07/2021

Domaine : Informatique   -   Thématique(s) : Bio-informatique et modélisation

Stages courts

Introduction à la programmation et à l’algorithmique pour les biologistes

Durée de la formation : 28 heures Dates : Lieu : Campus Jussieu Tarif : 1100 €

OBJECTIFS et compétences visées

  • Qu’est ce qu’un algorithme ? Analyse d’un problème.
  • Représentation et structures de données.
  • Liaisons entre les structures de données et les algorithmes.
  • Complexité d’un algorithme. Résolutions exactes et heuristiques.
  • Méthodes d’optimisation.

La mise en œuvre sera faite dans un langage de programmation interprété et souple (Python).

 

PUBLIC VISÉ ET PRÉ-REQUIS

Biologistes (au sens large), chercheurs, ingénieurs ou techniciens.

 

Aucun prérequis

Ingrid Lafontaine

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Philippe Lopez

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PROGRAMME

  • Cours : notions générales d’algorithmique et de programmation – présentation du langage Python (variables, structure de contrôle, fonctions)./ TP : utilisation des structures de données et des structures des contrôles de Python, fonctions.
  • Cours : algorithmes de tri. / TP : mise en oeuvre du tri (bulle, merge).
  • Cours : optimisation (simplexe, Monte Carlo et méthodes dérivées (recuit simulé), gradients). TP : dictionnaires, compte de mots, analyse du biais de GC sur un génome.
  • TP : optimisation suite (recuit simulé à partir duMonte Carlo, taboo search, gradient).
    Pour en savoir plus :
    http://abiens.snv.jussieu.fr/OBI/OBI2

Méthodes

  • Le public sera composé des stagiaires en formation continue et doctorants (maximum 14 personnes au total).
  • Les travaux pratiques sont encadrés par au moins deux enseignants.

 

Débouchés

Cette formation permet aux participants  de sécuriser leur parcours professionnel en leur donnant les compétences nécessaires pour accompagner les entreprises dans les enjeux liés à leur secteur d’activité et s’adapter aux évolutions technologiques associées.

Les + de la formation

  • Formation conçue en cohérence avec les besoins identifiés sur le marché du travail
  • Méthode pédagogique orientée vers l’acquisition d’outils stratégiques et opérationnels efficaces, complets, pertinents et innovants
  • Corps professoral composé d’enseignants-chercheurs et auteurs de renommée internationale

Pour candidater

Inscription obligatoire au moins 2 mois avant la session.

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Responsable(s)
pédagogique

Ingrid Lafontaine

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Philippe Lopez

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Informations

Session 1 du 21/03/2022
au 24/03/2022

Contact

01 44 27 82 82 formation.continue@sorbonne-universite.fr

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