Domaine : Informatique - Thématique(s) : Bio-informatique et modélisation
Stages courts
Algorithmique et programmation : notion de bases pour les biologistes (OBI2)
PROGRAMME
- Cours : notions générales d’algorithmique et de programmation – présentation du langage Python (variables, structure de contrôle, fonctions)./ TP : utilisation des structures de données et des structures des contrôles de Python, fonctions.
- Cours : algorithmes de tri. / TP : mise en oeuvre du tri (bulle, merge).
- Cours : optimisation (simplexe, Monte Carlo et méthodes dérivées (recuit simulé), gradients). TP : dictionnaires, compte de mots, analyse du biais de GC sur un génome.
- TP : optimisation suite (recuit simulé à partir du Monte Carlo, taboo search, gradient).
Pour en savoir plus :
http://abiens.snv.jussieu.fr/OBI/OBI2
OBJECTIFS et compétences visées
- Qu’est ce qu’un algorithme ? Analyse d’un problème.
- Représentation et structures de données.
- Liaisons entre les structures de données et les algorithmes.
- Complexité d’un algorithme. Résolutions exactes et heuristiques.
- Méthodes d’optimisation.
La mise en œuvre sera faite dans un langage de programmation interprété et souple (Python).
PUBLIC VISÉ ET PRÉ-REQUIS
Biologistes (au sens large), techniciens, techniciennes, chercheurs, chercheuses ingénieurs, ingénieures.
Aucun prérequis
PROGRAMME
- Cours : notions générales d’algorithmique et de programmation – présentation du langage Python (variables, structure de contrôle, fonctions)./ TP : utilisation des structures de données et des structures des contrôles de Python, fonctions.
- Cours : algorithmes de tri. / TP : mise en oeuvre du tri (bulle, merge).
- Cours : optimisation (simplexe, Monte Carlo et méthodes dérivées (recuit simulé), gradients). TP : dictionnaires, compte de mots, analyse du biais de GC sur un génome.
- TP : optimisation suite (recuit simulé à partir du Monte Carlo, taboo search, gradient).
Pour en savoir plus :
http://abiens.snv.jussieu.fr/OBI/OBI2
Méthodes
- Le public sera composé des stagiaires en formation continue et doctorants (maximum 14 personnes au total).
- Les travaux pratiques sont encadrés par au moins deux enseignants.
Modalités d’évaluation
Certificat de réalisation
Débouchés
Cette formation permet aux participants de sécuriser leur parcours professionnel en leur donnant les compétences nécessaires pour accompagner les entreprises dans les enjeux liés à leur secteur d’activité et s’adapter aux évolutions technologiques associées.
Les + de la formation
- Formation conçue en cohérence avec les besoins identifiés sur le marché du travail
- Méthode pédagogique orientée vers l’acquisition d’outils stratégiques et opérationnels efficaces, complets, pertinents et innovants
- Corps professoral composé d’enseignants-chercheurs et auteurs de renommée internationale
Pour candidater
Inscription obligatoire au moins 2 mois avant la session.
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Contactez-nousResponsable(s)
pédagogique
Informations
| Session |
du 03/02/2025
au 06/02/2025 |
|---|
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