Domaine : Sciences du vivant - Thématique(s) : Bio-informatique
Stages courts
Introduction à l’analyse bio-informatique des séquences (OBI3)
L’analyse des séquences des macromolécules est un des aspects fondamentaux de la génomique actuelle. Ce stage permet de s’y former d’un point de vue théorique et pratique.
PROGRAMME
- Alignements 2 à 2 (NWS, Smith&Waterman).
- Alignement globaux, alignements par blocs.
- Scores d’alignements.
- Validation statistique.
- Banque de données.
- Algorithmes de recherche de similarités dans les banques (algorithmes de FASTA, BLAST, SSEARCH).
- Détermination des motifs – recherche de motifs sur les séquences ou sur les banques – Application à la localisation de zones codantes.
OBJECTIFS ET COMPÉTENCES VISÉES
- Le stagiaire comprendra les méthodes et les algorithmes utilisés en génomique et en analyse de séquences.
- Il se familiarisera avec l’utilisation des outils bioinformatiques disponibles en ligne.
- L’accent sera mis sur l’utilisation raisonnée des logiciels afin d’amener le stagiaire à avoir une analyse critique des résultats.
PUBLIC VISÉ ET PRÉ-REQUIS
Public : Biologistes (au sens large), techniciens, techniciennes, chercheurs, chercheuses ingénieurs, ingénieures.
Pré-requis :
Connaissances de base en biologie moléculaire. Habitude du travail sur ordinateur et de l’utilisation d’Internet.
PROGRAMME
- Alignements 2 à 2 (NWS, Smith&Waterman).
- Alignement globaux, alignements par blocs.
- Scores d’alignements.
- Validation statistique.
- Banque de données.
- Algorithmes de recherche de similarités dans les banques (algorithmes de FASTA, BLAST, SSEARCH).
- Détermination des motifs – recherche de motifs sur les séquences ou sur les banques – Application à la localisation de zones codantes.
Méthodes
- Le public sera composé des stagiaires en formation continue et doctorants (maximum 14 personnes au total).
- Les travaux pratiques sont encadrés par au moins deux enseignants.
Documents : Supports de cours PDF
Modalités d’évaluation
Certificat de réalisation
Débouchés
Cette formation permet aux participants de sécuriser leur parcours professionnel en leur donnant les compétences nécessaires pour accompagner les entreprises dans les enjeux liés à leur secteur d’activité et s’adapter aux évolutions technologiques associées.
Les + de la formation
- Formation conçue en cohérence avec les besoins identifiés sur le marché du travail
- Méthode pédagogique orientée vers l’acquisition d’outils stratégiques et opérationnels efficaces, complets, pertinents et innovants
- Corps professoral composé d’enseignants-chercheurs et auteurs de renommée internationale
Pour candidater
Responsable(s)
pédagogique
Informations
Catégorie de l’action de développement des compétences:
(Article L6313-1 du Code du Travail)
Action de formation
Effectifs : Min 1 pers. / Max 4 pers. Intégation dans un groupe de 16 participants (doctorants, étudiants, stagiaires formation continue)
Possibilité de sessions sur-mesure ou INTRA Entreprise Contact : christine.mantecon/at/sorbonne-universite.fr
| Session |
du 20/01/2025
au 23/01/2025 |
|---|
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