biosciences

Enseignant-chercheur à Sorbonne Université depuis 2001.

Maître de conférences en systématique et évolution.

Maître de conférences – Sorbonne Université, Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité

Équipe homologies.

UMR 7205, SU, MNHN, CNRS, EPHE, UA.

Missions

Co-Responsable du stage :

  • OBI1 : Unix/Linux : informatique pour la biologie,
  • OBI2 : Algorithmique et programmation : notions de base pour les biologistes,
  • OBI3 : Introduction à l’analyse bioinformatique des séquences,
  • OBI4 : Phylogénie moléculaire,
  • OBI5 : Conception d’une base de données relationnelle appliquée à la biologie,
  • OBI6 : Génomique des Populations (analyse de données populationnelles).

Intervention dans le stage :

  • OBI1 : Unix/Linux : informatique pour la biologie,
  • OBI2 : Algorithmique et programmation : notions de base pour les biologistes,
  • OBI5 : Conception d’une base de données relationnelle appliquée à la biologie,

Techniques maîtrisées :

  • Bioinformatique, phylogénie, taxonomie.
  • Métabarcoding.

Laboratoire et thème de recherche actuel :

  • Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité, UMR 7205, SU, MNHN, CNRS, EPHE, UA. Équipe homologies.
  • Modèles d’études : acanthomorphes et faune méga-épibenthique antarctique.

Dernières publications

  • M. Cecchetto, A. Dettaï, C. Gallut, M. Obst, P. Kuklinski, P. Balazy, M. Chelchowski, M. Małachowicz, A. Poćwierz – Kotus, M. Zbawicka, H. Reiss, M. P. Eléaume, G. F. Ficetola, C. Pavloudi, K. Exter, D. Fontaneto, S. Schiaparelli. Seasonality of primary production explains the richness of pioneering benthic communities. Nature Communications. Accepté.
  • J. A. Ballesteros, E. V. Setton, C. E. Santibáñez López, C. P. Arango, G. Brenneis, S. Brix, E. Cano-Sánchez, M. Dandouch, G. F. Dilly, M. P. Eléaume, G. Gainett, C. Gallut, S. McAtee, L. McIntyre, A. L. Moran, R. Moran, P. J. López-González, G. Scholtz, C. Williamson, H. A. Woods, W. C. Wheeler, and P. P. Sharma. Phylogenomic resolution of sea spider diversification through integration of multiple data classes. Molecular Biology and Evolution, 38(2): 686–701, 2020. doi: 10.1093/molbev/msaa228.
  • T. Saucède, M. Eléaume, Q. Jossart, C. Moreau, R. Downey, N. Bax, C. Sands, B. Mercado, C. Gallut, and R. Vignes-Lebbe. Taxonomy 2.0: computer-aided identification tools to assist antarctic biologists in the field and in the laboratory. Antarctic Science, 33(1): 39–51, 2021. doi: 10.1017/S0954102020000462.
  • L. N. Michel, B. Danis, P. Dubois, M. Eléaume, J. Fournier, C. Gallut, P. Jane, and G. Lepoint. Increased sea ice cover alters food web structure in East Antarctica. Scientific Reports, 9(1): 8062, 2019. ISSN 2045-2322. doi: 10.1038/s41598-019-44605-5.
  • Y. Ben Chehida, M. Eléaume, C. Gallut, and G. Achaz. The rapid divergence of the Antarctic crinoid species Promachocrinus kerguelensis. bioRxiv, 666248, 2020. doi: 10.1101/666248.